O Plano da Bacia formulado pelo Comitê tem como origem uma ampla articulação que se iniciou em 1999 visando o  fortalecimento de uma parceria regional, que culminou com a criação do Consórcio Intermunicipal Lagos – São João  (CILSJ) em dezembro daquele ano. Um resumo histórico do processo pode ser obtidos no website do CILSJ  (www.lagossaojoao.org.br). A partir de então, foram realizadas diversas atividades, reuniões, seminários e projetos  que geraram um acúmulo valioso de conhecimentos e experiências, que muito ajudou na preparação do Plano.

• Plano das Bacias Hidrograficas da Regiao dos Lagos e do rio São João / Paulo Bidegain, Luiz Firmino Martins Pereira – Rio de Janeiro: 
  

Trabalhos Complementares:

• Mapeamento dos Sistemas de Relevo da Bacia do Rio São João, V.S. Seabra Candeias, C.B.M Cruz, R. S. Vicens – Recife – PE, 27-30 de Julho de 2010 p. 001-004 
  
• Análise político-institucional da gestão das águas na Bacia Lagos São João, RJ – Lima-Green / UERJ 2008